تأسس قسم علم الحاسوب عام 1991 بهدف رفد سوق العمل المحلي والإقليمي بخريجين متميزين بمعرفة علمية وخبرة عملية في مجال علم الحاسوب وتكنولوجيا المعلومات. ومنذ تأسيسه دأب القسم على تطوير الخطط الدراسية بما يتناسب مع التطورات المتسارعة في مجال تكنولوجيا المعلومات حيث حصل القسم على الاعتماد الدولي من المؤسسة الدولية  Accreditation Board for Engineering and Technology (ABET)  كأول قسم يحصل على هذا الاعتماد الدولي في الأردن وقد تم رفد الهيئة التدريسية بأعضاء جدد في تخصصات مختلفة تتماشى مع حاجات القسم والتقدم العلمي والتكنولوجي.

كما تم استحداث موضوعات جديدة وتخصصات متطورة في مجال الدراسات العليا في علم الحاسوب؛ إذ يشرف القسم على برنامج ماجستير أمن نظم المعلومات والجرائم الرقمية و برنامج ماجستير علم الحاسوب. و برنامج الدكتوراه في علم الحاسوب

 وتوسع القسم في الانفتاح على سوق العمل بصورة كبيرة، حيث تم تطوير علاقات متميزة مع كبريات شركات تكنولوجيا المعلومات المحلية والعالمية. وانتهج القسم خطة تعاون طموحة مع المؤسسات الأكاديمية والجامعات المرموقة في العالم العربي وفي أوروبا وأمريكا، بهدف تبادل الخبرات ونقل المعرفة والتكنولوجيا والاستفادة من كل ما هو جديد في هذا المجال. ورافق ذلك العديد من الانجازات العلمية والأكاديمية التي وضعت الكلية في المرتبة الأولى بين كليات تكنولوجيا المعلومات في الأردن.