النظام الأكاديمي تحقيقاً لرؤية الجامعة بأن تصبح مركزاً إقليمياً للتميز البحثي العلمي، عالمي الارتباط؛ وتزويد السوق محلياً وإقليمياً وعالمياً بخريجين مؤهلين تأهيلاً عالياً فقد أولت كلية الملك عبد الله الأول للدراسات العليا والبحث العلمي اهتماماً كبيراً لحث طلبة البكالوريوس على الانخراط في النشاط البحثي في الجامعة. لذا قد تم إدخال المقررات المتضمنة للمشاريع لبرامج البكالوريوس في جميع الكليات إضافة إلى مشروع التخرج الذي أصبح حجر أساس في جميع برامجنا لمرحلة البكالوريوس. لذلك أنشأت كلية الملك عبد الله الأول للدراسات العليا والبحث العلمي برنامج الباحثين من طلبة البكالوريوس. ويهدف هذا البرنامج إلى دعم طلبة البكالوريوس في تنفيذ مشاريع التخرج من خلال تقديم بعض الدعم المالي. في العادة، يحدد القسم الأكاديمي مشرفاً أكاديمياً للطالب أو مجموعة من الطلبة يعملون على مشروع تخرج مشترك. يقوم الطلبة ومشرفهم بتحضير وكتابة مشروع ومقترح يحدد أهداف المشروع ويقدم وصفاً واضحاً وقصيراً له، وتحديد الاحتياجات الضرورية إلى جانب تقدير الدعم المالي المطلوب. ويقدم هذا المشروع الى كلية الملك عبد الله الأول للدراسات العليا والبحث لاتخاذ القرار المناسب، ويقدم الطلبة تقريراً عن تقدم المشروع وتقريراً نهائياً يظهر النتائج الأولية التي توصلوا اليها، وتطبق حوافز النشر العلمي المعمول بها في الجامعة على ما ينتج عن هذا المشروع من نشرات علمية.